Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF304Q9HCX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF304Q9HCX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms