Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4Q9HBW1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC4Q9HBW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4Q9HBW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4Q9HBW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms