Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POPDC2Q9HBU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POPDC2Q9HBU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POPDC2Q9HBU9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms