Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM27Q9HBJ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM27Q9HBJ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM27Q9HBJ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms