Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPV4Q9HBA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPV4Q9HBA0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPV4Q9HBA0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms