Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ELL3Q9HB65 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ELL3Q9HB65 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms