Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLK4Q9HAZ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK4Q9HAZ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms