Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG4Q9H9E3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG4Q9H9E3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG4Q9H9E3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms