Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8M5

CNNM2, Metal transporter CNNM2, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2Q9H8M5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNNM2Q9H8M5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM2Q9H8M5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM2Q9H8M5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms