Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPF2Q9H7B2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPF2Q9H7B2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPF2Q9H7B2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms