Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHX3Q9H6B9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHX3Q9H6B9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHX3Q9H6B9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHX3Q9H6B9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHX3Q9H6B9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms