Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRTNQ9H040 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRTNQ9H040 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms