Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TGIF2Q9GZN2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms