Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTMR12Q9C0I1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
MTMR12Q9C0I1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms