Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASXL3Q9C0F0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASXL3Q9C0F0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASXL3Q9C0F0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms