Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF518BQ9C0D4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF518BQ9C0D4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF518BQ9C0D4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms