Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLDIP3Q9BY77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLDIP3Q9BY77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLDIP3Q9BY77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLDIP3Q9BY77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLDIP3Q9BY77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLDIP3Q9BY77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLDIP3Q9BY77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms