Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRRTQ9BXP5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SRRTQ9BXP5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRTQ9BXP5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRTQ9BXP5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRRTQ9BXP5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms