Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A9Q9BXP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC12A9Q9BXP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC12A9Q9BXP2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC12A9Q9BXP2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms