Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHID1Q9BWS9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHID1Q9BWS9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms