Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf43Q9BWL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C1orf43Q9BWL3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms