Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms