Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SELENOOQ9BVL4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SELENOOQ9BVL4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SELENOOQ9BVL4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms