Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KATNB1Q9BVA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms