Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3CQ9BUI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR3CQ9BUI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms