Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPON2Q9BUD6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPON2Q9BUD6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPON2Q9BUD6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms