Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCMBPQ9BTE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCMBPQ9BTE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCMBPQ9BTE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms