Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTA3Q9BTC8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTA3Q9BTC8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTA3Q9BTC8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms