Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNPY3Q9BT09 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNPY3Q9BT09 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms