Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERPUD2Q9BSE4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERPUD2Q9BSE4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERPUD2Q9BSE4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms