Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIKE1Q9BRV8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIKE1Q9BRV8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIKE1Q9BRV8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms