Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOK1Q9BRS2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RIOK1Q9BRS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms