Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM2D3Q9BRN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TM2D3Q9BRN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms