Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF559Q9BR84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF559Q9BR84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms