Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C19orf43Q9BQ61 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C19orf43Q9BQ61 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C19orf43Q9BQ61 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms