Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NIPSNAP1Q9BPW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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