Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKP4Q99569 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKP4Q99569 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKP4Q99569 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms