Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MMP19Q99542 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP19Q99542 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP19Q99542 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms