Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YME1L1Q96TA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YME1L1Q96TA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
YME1L1Q96TA2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YME1L1Q96TA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms