Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UHRF1Q96T88 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UHRF1Q96T88 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.7 ms