Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC42.8■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
RSF1Q96T23 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC42.74■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
RSF1Q96T23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC42.64■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
RSF1Q96T23 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC42.58■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC42.57■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
RSF1Q96T23 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
RSF1Q96T23 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms