Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3IPQ96QF0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3IPQ96QF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms