Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMG1Q96Q15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMG1Q96Q15 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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