Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UHRF2Q96PU4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UHRF2Q96PU4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UHRF2Q96PU4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms