Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC138Q96M89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms