Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC74BQ96LY2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC74BQ96LY2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC74BQ96LY2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms