Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C8orf48Q96LL4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C8orf48Q96LL4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C8orf48Q96LL4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms