Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPZA3Q96KX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPZA3Q96KX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPZA3Q96KX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms