Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNIP3Q96KP6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNIP3Q96KP6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms