Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
JPH4Q96JJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
JPH4Q96JJ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
JPH4Q96JJ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
JPH4Q96JJ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
JPH4Q96JJ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
JPH4Q96JJ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms